Le succès de l'Initiative mondiale d'éradication de la poliomyélite repose sur le partenariat qu'elle a réussi à créer.

L'Initiative est coordonnée par l'Organisation mondiale de la santé. En 2002, 3000 personnes travaillaient à temps plein pour la campagne d'éradication, dont le quartier général se trouve au siège de l'OMS, à Genève.

Le Rotary est depuis le début le principal soutien de l'Initiative. La décision de l'OMS de s'engager dans l'éradication de la polio prit, d'ailleurs, la suite d'une campagne intitulée PolioPlus du Rotary International, qui était quasiment parvenue à faire disparaître la polio des Amériques. Le Rotary s'est engagé à atteindre un financement total de 500 millions de dollars d'ici 2005. Plus d'un million de Rotariens dans le monde ont participé directement à la campagne.
Un autre des principaux partenaires, les Centres de surveillance et de prévention des maladies américains (Centers for Disease Control and Prevention, CDC), était également déjà engagé dans l'éradication de la polio avant 1988. Les CDC apportent une aide technique, notamment pour la mise en place des réseaux de surveillance de la polio et des laboratoires de référence.

Enfin, le quatrième grand partenaire est l'UNICEF, le Fonds des Nations unies pour l'enfance. L'organisation procure les vaccins et les moyens d'assurer la chaîne du froid. Elle contribue à la formation des personnels de santé qui participent à la vaccination et aux campagnes de sensibilisation de la population. Une grande partie des vaccins contre la polio sont achetés par l'UNICEF et transitent par ses entrepôts d'Amsterdam, avant d'être expédiés sur le terrain.

Un premier objectif d'éradication avait été fixé à l'an 2000. En grande partie par défaut de moyens, il dut être repoussé à 2005. De nouveaux partenaires rejoignirent alors l'Initiative. Parmi eux, la Fondation Bill et Melinda Gates donna 50 millions de dollars et la société de diamantaires De Beers, 2,7 millions. Le 11 octobre 1999, Aventis Pasteur annonça un don de 50 millions de doses de vaccin pour cinq pays africains, suivi d'un don de 30 millions de doses en 2002. Des gouvernements fournirent des subventions, ou augmentèrent celles qui étaient prévues. Des personnalités devinrent ambassadeurs de la cause de l'éradication de la polio, comme le mannequin Claudia Schiffer, la championne de tennis Martina Hingis, les acteurs Roger Moore et Mia Farrow, ou encore Ted Turner, l'homme d'affaires et président de la Fondation des Nations unies.